Depuis le début de l'ère shinobi, les ninjas restent fermés entre eux sous forme de familles, souvent appelés Clans. Ne parvenant pas à trouver des points d'ententes, il n'est pas rare que ces derniers se livrent des guerres fratricides dans l'unique but de montrer leur puissance et d'étendre leurs territoires. De cette guerre particulièrement féroce se démarquèrent deux clans, tous deux plus puissants que leurs congénères pour des raisons qui leurs sont propres : Le clan des Senju, dominant la forêt, et le clan des Uchiha, arborant l'éventail qui souffle le vent. Un accord fût traité par les deux Chefs de clans de l'époque afin de s'unir et d'empêcher l'autodestruction totale des deux puissances, à force de combat. L'union née de cet accord fonda par la suite le Village de Konoha, le tout-premier village caché, avec à sa tête le Chef des Senju ; Senju Kôketsu, le premier des Hokage. L'Histoire n'a en revanche jamais retenu le nom du Chef du clan des Uchiha. Certains racontent qu'il se serait retiré dans les ombres pour continuer une vie parsemée d'aventures et de combat dont raffolent particulièrement les membres de son clan, d'autres s'accordent sur le fait qu'il aurait été éclipsé des décisions du village par peur qu'il ne trahisse le nouvel accord déjà bien fragilisé par les guerres passées.

Les années passèrent et le Village continua de croître, afin de devenir une puissance militaire si forte qu'elle pourrait, selon des conseillés hauts-placés du Daimyo, risquer de faire vaciller son pouvoir. Que ces rumeurs soient avérées ou non, la suprématie de Konoha était, elle, bien réelle : à mesure que le Village continuait de prendre de l'ampleur, divers clans du monde Shinobi restés dans d'autres pays en guerre s'allièrent à eux pour négocier un traité de paix. Parmi eux sont comptés des clans du Pays de l'Eau tels que les Hozuki ou les Kaguya, les Chikamatsu du Pays du Vent ou encore les tristement célèbres Yotsuki qui faisaient parler d'eux au Pays de la Foudre. L'économie grandissante du Village, sa puissance militaire et sa position au centre de la plupart des routes commerciales du Pays et du Monde ont rapidement établis Konoha comme étant la puissance mondiale régissant la Paix dans le Monde. Une période qui dura environ deux décennies.

Mais en ces temps plus troubles, la paix vient à vaciller. De récents rapports font état d'une vague de criminalité et notamment de banditisme naissante dans la partie Sud du Pays du Feu. Certaines ressources, d'ordinaire abondantes, se font plus rares. L'économie de Konoha s'appauvrit, la menace grandit... comme si quelqu'un essayait de couper l'herbe sous les pieds du village.